Ci sono, all’interno del libro, almeno tre linee narrative. Nella prima, il diavolo arriva a Mosca deglianni ‘20 con il proprio codazzo di buffi e perfidi collaboratori e punisce viltà, meschinerie e soprusi divertendosi alle spalle di funzionari del potere sovietico, burocrati e moscoviti da lui giudicati immorali. Nella seconda, si racconta il “romanzo di Pilato”. Un Pilato tormentato, forse consapevole di avere crocifisso il vero Dio. La terza linea narrativa, invece, segue la vicenda del Maestro, chiuso in manicomio: ha scritto e bruciato un romanzo (appunto quello su Pilato) che le autorità non approvano; ama, ricambiato, Margherita, che accetterà di vendere la propria anima al diavolo per salvare il Maestro.